mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTTGTTTGGGTTTGTTTTC GTTAGGCATGACTACAAAA TTCTGACTTTTTTGTTGTTTGGGTTTGTTTTCTGGCCACTCCTGTGGATATCTACCTTATCTGTATGACCAAGATAACAGGACTGTGGATCCGGCTCAAGGGTTAAGCATATGCTTAGCATGAGTGAAGCCATGATGGCAGAGTTAGGCATGACTACAAAAGTACCTAT CTTTTAATGCAATCTCCAATATAAATGTTCATGGATTTCTCGGTGATATTTTTTAACAGCAAAATTACTTCTAATTTTTTTTGAAAATGTATTTATTTTTTTCATGTGCACAGGTGGAACTGGAGTTACAGAGACTTGTGAGCTGCTACAGGTGCTGGGAATCGAACACAGGTCCTCTGGAAGAGTAGCCAGTGCTTTTAACCACTGAACCATCTTTCCAGCCCCACTTCTAATTTTTAATTCCCTCTTTCACTTCTGACTTTTTTGTTGTTTGGGTTTGTTTTCTGGCCACTCCTGTGGATATCTACCTTATCTGTATGACCAAGATAACAGGACTGTGGATCCGGCTCAAGGGTTAAGCATATGCTTAGCATGAGTGAAGCCATGATGGCAGAGTTAGGCATGACTACAAAAGTACCTATTTCACAGGGCTGTTGTAAGAGTCGACTGAGAAAAA 4 2 5' arm Mus_musculus mirnest 100 100 -43.6 ........(((((((.(((...(((((..(((((.(((.((((((...(((((..................))))))))))).(((((.((..(((((...(((((((....))))))).)))))))..))))).)))))))).)))))..))).)))))))....... (-43.6)