mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGCAGTGGAGGTGCATGCC TGTGCACCACCACACTCAGC CCAATCCCCGCTGGGCAGTGGAGGTGCATGCCTTTAATCCCAGTACTTGGAAGGGAGGCAGAGGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCTGGA AATACTCTCCAATATTTAGAATATAAATGGTTAGAATGACAATCGAAGATTTACATCTTAAGGGTGATGTTACAGATCAAAGAAACCTTAACACCTGTGCTCTCTTTGAATGCCTGAAAGAACACATAAAATTTGTACCTCTCTAATTCATCTCTGTTCATCAGGAAACAAGGGTATTGGGATCCAAATGGAATTGACCAGAAAGCTTTAAAACTTTGTGTTTATGTGACAAGAATGTTCTGTTTAAAACCAATCCCCGCTGGGCAGTGGAGGTGCATGCCTTTAATCCCAGTACTTGGAAGGGAGGCAGAGGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCTGGACTCTGTTACATAAACTACTGGGGCAAAACTGCTGGCCCCTGGAGGAGAACTAGTGGCTTTTAAGAGGGCAACAGTTGTCACTCTTGGATAAGAAGACTAGTGCTTACCAAGCACAGGCATGGTTAGACATTGCAGAAGACTCTAAATAAACTTGAATGAGTTTAATTCCTCAGCCACACTTG 2 1 5' arm Mus_musculus mirnest Metazoa_SRP 0.00008 mmu-mir-1186 0.000004 -38.7 ....(((..((((((..((((.(((((((((((((..((((...........))))...))))))))))))).)))).)))))).....))) (-38.7)