mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGGTTGGTGTTACCCACCA GTGGGTAACACACCAACCGGGAC TAGTCCGGTTGGTGTTACCCACCAGGACTAAATGTTTCGATCTTTAGTTCCGGTGGGTAACACACCAACCGGGACTA 1 3 5' arm Oryza_sativa pmrd 100 100 -46 (((((((((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))))..))))))))).)))))) (-46.00)