mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTGGGGACGGGAGGGGAGA TCTACTCTCTGCCAAAGTTT CCTGGATATATTTCTACTCTCTGCCAAAGTTTTGTAAGAACAATACAGAATTTGGGGACGGGAGGGGAGATACTTTGAG TCGCGCTGCTACACCGCGGGCAGCGCATGGCGGGCATGGCGCTGGCGCGATCATGGAAGCAGATGTCCTGGTTCTACTACCAGTACCTGCTGGTCACTGCGCTCTACATGCTGGAGCCCTGGGAGCGCACCGTGTTCAATTCGATGCTGGTTTCCGTGGTGGGGATGGCCCTGTACACTGGCTACGTCTTCATGCCCCAGCACATCATGGCTATTCTGCATTACTTTGAAATTGTACAGTGACGAAGATGTGACCAGGATCCAGAGGTTCCTGGGGAAGATCTGCCTTGTGAAGTTGGAATGAGACCTCATCAGATGTAAGATGTGCTACGGATGTCCACGTGACCAACCTTATAAATACAAAGACTTTAAAAAAAACTTCATGAGTAGAACAGGAAAAATCATCCTGGCTCATGTGTTGTGTTCTTTCTTTTTGATTTTAACAGAGGCTCTTATATAGTAGCTTTTATCTATTTTAACATTGTAGTCATTTGTACTTTGATATCAGTATTTTCTTAACCTTTGTGACTGTTTCAATATTATCCAGTGAAAGCTTTTCTTAATGTAACTTTGAGTACATCTCAATTGCCTTCTATTTTTAAAACCTAAGGTCATTAGTTGGGCTTTACTGTTCTTGCTATCATATGGCATATACATCTGCCTGGATATATTTCTACTCTCTGCCAAAGTTTTGTAAGAACAATACAGAATTTGGGGACGGGAGGGGAGATACTTTGAGAACTACTTACAAAAGAGTTATCTGCTTGCTTGAACTCAGGAGTACGGTNTTAGCTCCCTAGACTCTTAACAGCTNTTGCTCTAAAAGCTATTAAGTGTNTCTTAGTAATGAAAGAGTAAGATCTTGCTAACATTAATACAAGGACATTCNACCTTTAGGTATAAATCTTCATGTGGCTATTTCACCCACTTTGATGATCCTGTATTGGGTAGTGGGGCGGGTTGTATGAATAGCGCAGAAATCGTGGAGCTTTTACAGGGTATAGATCCTAGGCATTTA 4 1 3' arm Mus_musculus mirnest 100 mmu-mir-1892 3e-22 -22.5 ........(((((((.(((((..((.((((((((((.......))))))))))..))..))))).)))))))....... (-22.5)