mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTGCTTGTTTGTGTGCCC GCACACAAACGAGCAATTGG CATACAAATTGCTTGTTTGTGTGCCCACATGCATATCAAGGCATGTGGGCACACAAACGAGCAATTGGATG 0 0 5' arm Oryza_sativa pmrd 100 100 -48.4 (((...((((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))))..))) (-48.40)