mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTGTCCAACGTTTGACTGTC CGGTCAAACGTTGGGCACGGA TCTGGGTTTTCGTGTCCAACGTTTGACTGTCTATCTTATATATTTTTTTATAATTAATATTTTTATTGCTGTTAGATGATAAAACATGATTAATACTTTATGCATGACTTATCTTTTTAATTTTTTTATAATTTTTTCAAATAAGACGGACGGTCAAACGTTGGGCACGGAAATCCAGG 0 0 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR812 1e-42 osa-MIR812o 1e-23 -70.73 .((((((((((((((((((((((((((((((..((((((........((((((.(((((....)))))..((((((.(((((..((((..(((....)))..))))..)))))..))))))....)))))).........))))))..)))))))))))))))))))))))))))))). (-70.73)