mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTACTCCCTATGTCCCAAAA TTGGGACGAAGGGAGTAG CTACTCCCTATGTCCCAAAATATCGACTTGGCACTACTAATACTAGGTTTTGCTGAAGAATATTTTGGGACGAAGGGAGTAG 1 0 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR1122 0.0003 100 -40.6 (((((((((.((((((((((((((...(..(((..(((.......)))..)))..).).))))))))))))).))))))))) (-40.60)