mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGACTCATCTATGACGGGC CCGTCACAGATGAGTCATCTG GTTAATGCCCGTCACAGATGAGTCATCTGTGACGTGCTATAATTAATGCCCGTCACAGATGACTCATCTATGACGGGCTATAGTTAAT 1 0 3' arm Oryza_sativa pmrd MIR821 0.00000008 100 -55 ((((((((((((((.(((((((((((((((((((.((..........)).))))))))))))))))))).))))))))....)))))) (-55.00)