mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGAGTCATCAGTGACGGGCC CATTAGTATGCACCCCGTCACCGATGAGTCATCAG TTACCCTATGGCCGATCACAGATGAGTCATCAGTGACGGGCCTGATTGTCATCTCAATCGGGCATTAGTATGCACCCCGTCACCGATGAGTCATCAGTGACGGGCCCTACGGTAA 3 0 5' arm Oryza_sativa pmrd MIR821 7e-55 100 -60.1 .((((.((.((((..((((.(((((.(((((.((((((((.(((((((......)))))))((((....))))..)))))))).))))).))))).))))..)))).)).)))). (-60.10)