mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGATGTGTCCCATCCAGT TAGATGGGACACATCCTAAT ACCTTATATTAGATGGGACACATCCTAATACGACGAATCTGGACATAGTCCTGTCCAGTTTCGTTGTATACAAGGATGTGTCCCATCCAGTACAAGGT 2 0 3' arm Oryza_sativa pmrd MIR1122 1e-49 osa-MIR1862g 0.00000008 -59.8 (((((.((((.(((((((((((((((.((((((((((.(((((((......))))))).))))))))))...))))))))))))))).)))).))))) (-59.80)