mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTTGGTGCCCGTCACGGATGA ATCTGTGACAGGCCCCAACTCA GATTGTCATCTGTGACAGGCCCCAACTCAAGACCCGTTTGAGATATGGAATGTTATCTCAGTCGGGCCTAAAGTTGGTGCCCGTCACGGATGATGGTC 2 0 3' arm Oryza_sativa pmrd 100 osa-MIR817 0.000000005 -57.9 (((..(((((((((((.(((.((((((..((.((((.((((((((........)))))))).)))).))..)))))).))).)))))))))))..))) (-57.90)