mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGATCATGTGGCAGTCTCAGC TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG TTCGTGTTCGTGGGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTAATATTGCTCTCGCCAGTTGCTTTTGGGTACCAGATCATGTGGCAGTCTCAGCAACTCCCTTGCAGACAT GGAGCATCTTGTTCGTGTTCGTGGGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTAATATTGCTCTCGCCAGTTGCTTTTGGGTACCAGATCATGTGGCAGTCTCAGCAACTCCCTTGCAGACATTATTATAACAATTTACGCAGCACCTCTGGAGTTTCAGATTCATCAAGCGTCTGTCCATGTTGAAATGATGATGTCTAATGTTTATTTATTTATTTAAATGTTAATAGGGATGTCCCTGACGCTAAATGCAGGTGTACGCAGCTTGGGGTTCGGAGGGAAATGATGGTTTCGTGGACCACTCGCTTCTGGAGTTAATAACGCAAAGCCCGCGTGGAGGCACACCATGAAGTTTGGGAGCAGTAGATGCGATACAATTAAATGAAGGGTCCTTTTCATCGCTTTTAAACTGGTACTTTGGAGCCTGCCCGTGAAGTCCCGTAGCGTTCATTGAGTTGCAAGATTAACAGCATGTGATGATGTGTAAGCTGCCCAAAACGTCTTTTGTTTGGCTTTTGTAAACAGATATGTCATGCAAAAGAAATTTGTTTGAAGCCCTCTAGAACTGTAAAGTTATTTGCAGCTTTAGAGATTTGACTAATTTTCTGAGCGCATTCAACAGGAAATGGTATGATGTCTTAATGCACAAATTTTGCGTGTCATTTACCATTTCTTATTGCCGTATATATTTATAATTTTTGTTAAATGCTTGATGTTATTTACTTTGA 1 1 3' arm Cycas_rumphii mirnest MIR167_1 0.000000007 osa-MIR167i 0.0000000004 -51.4 ...(((((.(((((((..(((((.(((((((.(((((((((((...((..((.((....))..))...))...)))))))))))))))))).)))))..)))))..)).))))) (-51.4)