mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGCAGTGGTGGCACAC TTGAGTCCAGCCTGGTCTA AAGTAATTTGAGGCCGGGCAGTGGTGGCACACGCCTTTAATCTCAGCACTTGGGAGGCAGAGGTAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGTCCAGCCTGGTCTACAGAGTGA GGAAAATACGTAATAAATAAATAAATAAATGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATACATCATGCTTATTAGGCTTTTGGTTAGATGAATATGTATCACTGCTCTTGCCAACAATTAGGCAAAGGGTTGCAAAGTAAGAGATAATTTGTTTCCAATCTGTAACTGTTTAACTGTGTATACATATTGAACTTATAACATCACCATGCATAACTTAACATATCCAATGAAAAATTATTAAAAAGTAATTTGAGGCCGGGCAGTGGTGGCACACGCCTTTAATCTCAGCACTTGGGAGGCAGAGGTAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGTCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCATGACAGCTAGGGCTACACAGATACACA 4 2 5' arm Mus_musculus mirnest Metazoa_SRP 0.000001 mmu-mir-3470b 0.000000000006 -32.4 ......(((((((((((((..(((...((.((((((((..(((((.....)))))...))))))...(((....))).)).))...)))))))))))).)))).... (-32.4)