mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACAAATCACAGTCTGCCAT GGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT TGGATGTTGGCCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTAAAACGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCACCTCTAC CCACCACTTGTAATAATTTATACAGAGCCTGTAGAAAATGTAGAAGAGACATTGGATGTTGGCCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTTTAGATAACTAAAACGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGGCCACCTCTACAGGACAGATAATGATGGTGCTGTCAAACGCAGCATTTCACACCTTCCTCATGTTCCTTTGTCTTTCCTACCAAGTATTAACAGCTTCCAGTTTCATTTTCTTAACCCTGCACTACTACTGTCTATTAACATTTTCTTGAGTTTTACATTGCTTTAATTTATAGTTGCTATTGCTCTTTAAAAGTTCTTCTAATTGTAATGGACATGTTTATCATTTTAATTTATCATTGAAATTGTCTTAATGTTGATTAAGATGTTTTGAACAAAAATTCTAATTCGTACTTTTTTTTCTTTTCTTTATAGTGTGAAGCACGATGCAGATGTTGAAGGAATCTAATGCAGATATGTTTTCCTTTTAAAGTGTGAAGCAGTATTCTGGAAGTTTTTCTAAGACTGTGAAGAACGAAGGAGGTCTGC 1 2 3' arm Mus_musculus mirnest mir-7 8e-36 mmu-mir-7a-1 6e-55 -41.9 .(((.((.(((((.((.((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))))))))).))).. (-41.9)