mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTGCCGCCAGGTTTTGAGTGT ACTCAAACTGGGGGCTCTTTTG AGCCTGTGATACTCAAACTGGGGGCTCTTTTGGATTTTCATCGGAAGAAAAGTGCCGCCAGGTTTTGAGTGTCACCGGT TCGAAGAAAGGAATGAGACTGAGTATAGCGAAAGGCTAGGGATGGGCATCCTGCCCAGTAGACGGTAACTGAGGTGGTCGTTGTAGGGTACCTGGGGGCTCCATGTGCGTCCTGTCGCTGCTTGGAGCTGTTACACCTATGTAGCGGCCATCAAAGTGGAGGCCCTCTCTTGAGCCTGAATGAGAAAGTGCTTCCACTTTGTGTGCCACTGCATGGGGAAAACATCATAGCTTTGCATCTGACGCATCGGTTTACAGGAGCGGACAACCTGTGTGGGGGTTTAGGCTTGGAGTTTAATGGGTCCTATCCTAAAGAGGGCGGTTCAGTTGGGTGCCACGAGACGCGGATGGATGTAAGGCAGTCGTGAGTCCAGGTGCATTGTAGATTGTTCTTAAGCTTGACCTCCAGCCTGTGATACTCAAACTGGGGGCTCTTTTGGATTTTCATCGGAAGAAAAGTGCCGCCAGGTTTTGAGTGTCACCGGTTGAGAACTCAAAACGGCTAAGAACTAAGAATTAAGTTTTAGTGGGTCATGTTTTCACTGGGGTTGCATTTCTGGGCAGGTGGGTGTCACATGTGGGTTTGAGTCCGAACACTTGGGCGCATGCGGTACTAAAGGCTTTCCGCGTTCATAAAGGA 2 2 3' arm Mus_musculus mirnest mir-290 2e-38 mmu-mir-292 1e-39 -31.5 .(((.((((((((((((((((.(((.(((((((....)))((....)))))).))).))))..)))))))))))).))) (-31.5)