mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGGAGGACTGAGAAGGTGGA CATTGGTTAAGACCTCCAACA GGAGCCAGGATGCAGCCTGCTATGGAGGACTGAGAAGGTGGAGCAGTTCTGTACCGTGCTGCCTTCCATTGGTTAAGACCTCCAACAGTAAAGGGCTGCCCGGCC TCTTTGTAGAAGCAAGTGTGCCCTGGTCTGCCCCCTGGTTAGGTGGTGATTAAAATGACACTTGCTCTGCCCCCATAGCAGCTCCCTGAGCAGGACCACCTTTACACAGACATTTGAGTTGCCCCTGAGGTCAGTGGCCTACCCATGTTTTTTTGCCTAGTTTTCTATTCGATCGCTTGCTTTTTAAAAATCCCGTTGTGAGAACTCTTGGTGTGCTCTGATGTGCTGAGCAGTTCTGGAGCTAGATGGATGAACCTAGCCTTTCTGCTGCACTCCAGGCAAAGCCGAAATGGGCTCAGGCTGTATTCCAGGGCTGGACAGGTGCATAGGGTGGGGTTCCACCCTGATACAAAGTCGTATCCTAGGGAGCCAGGATGCAGCCTGCTATGGAGGACTGAGAAGGTGGAGCAGTTCTGTACCGTGCTGCCTTCCATTGGTTAAGACCTCCAACAGTAAAGGGCTGCCCGGCCAAAGAATGTCCTCTCTATCACCGTGGAGGGGCAGCACTGAGCTGGCCCACATTGT 5 0 5' arm Mus_musculus mirnest SNORA47 3e-38 mmu-mir-1940 2e-51 -39.3 ...(((.((..((((((((((.((((((.((.((..(((((((((((..........)))))..))))))..)).)).))))))..)))...)))))))))))). (-39.3)