mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCATTAAATGTTTGTTGAAT CAACAGACATTAATTGGGCG AATCCGGTGCACATTGTAGGCCTCATTAAATGTTTGTTGAATGAAAAAAATGAATCATCAACAGACATTAATTGGGCGCCTGCTCTGTGATCTCCA GGCTCTCGTCTATCAAACTAATCCGTAAGGGCAAGGATGGTGACTTTGTACTCACAGTGCCTAATCCGGTGCACATTGTAGGCCTCATTAAATGTTTGTTGAATGAAAAAAATGAATCATCAACAGACATTAATTGGGCGCCTGCTCTGTGATCTCCATGGGCTCAGCTTGTTCCTGCCAGTGGCCTTCAACGTTCAAGCTCTCCGCAGCGTCCTTATTTCTGCAGCTCATTCCTGTGTTCTGTGTAGTATAATCATAGTGGATATATTTTACCTTTCAAACCAATTCCAATTGATTGATAATTGTGCCTCGACTGTGTTTTATAAAAAGGATTCCATATCTGGTTCTTTTCTATCCTGAGGGTGTGGAAGGAAGGGATAATAGCTCATGTACCATAAATGTGATATTTTCTATGAAATACTGTATTTATGCCTGTGTTTTGGAAATGCCTGCTTGTCATTGTTGCATCTCTGTTGTTGTTACTATAATCGCTACCGATTACTCCCTAGGTTGGACTACAGTGATCACTGAGTA 4 0 5' arm Mus_musculus mirnest 100 hsa-mir-421 4e-28 -33.2 .....((..((((..((((((((((...((((((((((((.(((..........)))))))))))))))...)))).))))))..))))....)). (-33.2)