mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCAAAAGATTCGTCTCGCG CAAGACGAATCTTTTGAGCC GGAAATCACAAGACGAATCTTTTGAGCCTAATTAATTCGTCATTAGCACATGTGGGTTGCTATAGCACTTATGGCAAATCATGGGCTAATTAGACTCAAAAGATTCGTCTCGCGATTTCC 2 0 3' arm Oryza_sativa pmrd 100 osa-MIR445a 0.000000000006 -52.7 (((((((.(.((((((((((((((((.(((((...........((((.((((....(((((((((...)))))))))..)))).))))))))).)))))))))))))))).).))))))) (-52.70)