mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACATTTTTGCACAAAC GTGTGCGGAAATGCTTCTGCT TTTGATTTTAGTGGAAACATTTTTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTGT CAGAACATTTTTTGATTTTAGTGGAAACATTTTTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTGTAGGGTTTGCCTGCATTTTTTGGATCCTGCATTAGCAAGTGAAGGTAGCACATAGTTTAAAATAGTTTTTTGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGCTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTGCCTGTAATAAAATAATTCGATGACTATCTGT 4 0 5' arm Mus_musculus mirnest mir-147 5e-18 mmu-mir-147 1e-30 -22.1 ........((((((((.((((((((((((...................)))))))))))).))))))))....... (-22.1)