mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC GCTCTGGGGTTTTGTTCA TTGACAGAAGAGAGAGAGCACGCTAGGCTAGAGGTACAAAAGAGGCATTTTATATGAGAGAGATATGTAGCAATCCTCGCTTTTTAATAACCATGCCTGCTCTGGGGTTTTGTTCA 7 1 5' arm Prunus_armeniaca pmrd 100 far-MIR529 0.00009 -24.3 ..(((((((.....((((((.((..((..((((((......((((.((((((((((.......))))))).)))))))))))))......))..)).))))))....))))))).. (-24.30)