mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGGCTGGGA CCAGTCCCGAACCCGTCGG TCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCAAGAGCGGGTCGTCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGGCTGGGA 2 3 3' arm Populus_euphratica pmrd 100 peu-MIR2911 5e-49 -61.5 ((((((.((((..(((((((((((.((..(..((((((..(((((....)))))..))))))..)..)))).))))))..)))..)))))))))) (-61.50)