mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTAGAACTCGAGATATGGGC CCTATATCTTAGCTTTCTAGT TCTAGAACTCGAGATATGGGCTGAACACTGAACAATGTCTGGGTTGCAGGACAGATTCTGACTTCTCCGTTGTTGCTAAGATTTAGACTTCCAAATAGTAGAATTGAGTCTTTCACTCCTCATGAATGTTTTAGACCTATATCTTAGCTTTCTAGT 1 4 5' arm Populus_euphratica pmrd 100 peu-MIR2912a 3.0E-85 -39.59 .((((((((.(((((((((((((((.((......(((...((..((.(((((.(((((((.((........(((...........)))........)))))))))..))))).))..)).)))....))))))).))))))))))))..)))))). (-39.59)