mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTAGAACTCGAGATATGGGC CTATGTCTTAGCTTTCTATC TCTAGAACTCGAGATATGGGCTGAACACTGAATAGTGTCTAGGCTGCAGGACAGATTTCGACTTCTCTTTTGTTGCTACAATTTGAACTTGAAAACGGCTGTTTTGAATCTTAGACTCTTCATGAAAGTTTTAGGTCTATGTCTTAGCTTTCTATC 2 3 5' arm Populus_euphratica pmrd 100 peu-MIR2912b 3e-85 -46.6 ..(((((((.((((((((((((.((.(((....((.(((((((...((((((((.((((((.(((....((((....))))...))).))))))....))))))))...))))))).)).......))).)).))))))))))))))..))))).. (-46.60)