mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGGTGGTGACGGGTGACGGAG CTGCCCTATCAACTTTCGATGGT TTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTGACGGGTGACGGAG 5 4 3' arm Populus_euphratica pmrd SSU_rRNA_eukarya 6e-29 100 -24.5 .(((((((..(((.((..(.((((((((.......)))))))).).)))))..)).).)))). (-24.50)