mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGTCTAGCTCAGTTGGTA CAAACCGAGCGCGGACGGCGA TGCAAACCGAGCGCGGACGGCGAACTGGAGGGGACCACGCATAATATAAATATATATTATATGTGCGATCCCCAACACAACCAAGCCCGTCTAGCTCAGTTGGTA 4 1 3' arm Populus_euphratica pmrd 100 csi-MIR399b 0.0003 -38.8 (((.(((.((((..(((((((....((..((((((((((.((((((((....)))))))).)))).).)))))..)).......).)))))).)))).))).))) (-38.80)