mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCATTTTTGGCTACA AGGTTAGTGAAATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAAGCTTGATCAACTCTACTTTTTTAAGTACTTTTTATTATAGTTAAAAACTAAGAAGTGGAGATTAATAACTTTGACTGGCAAGTCATTTTTGGCTACATCTCTGCCTCA 1 0 5' arm Petunia_x_hybrida pmrd MIR169_2 5e-78 ptc-MIR169e 0.000000007 -56.3 ((((....((.(((.((((((((((((((((((((((((.(((.....(((((((((((..(((...(((((.......))))))))))))))))))).....))).)))).)))))))))))))))))))).))).)).)))).. (-56.30)