mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACATTTCTGCACAAAC GTGTGCGGAAATGCTTCTGCT GAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACATTTCTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTGTAGGGTTTG GCGTGGTCGCGGCCGAGGTACGCGGGGAACATCTCCTGGCCGCAGCCGCCCTAGATTTGGAATTCTACACTAAAGTCATCATGGGCGTTTTCCAGATATTGATGAAGAATAAGGAACTCATTCCTTTGGCGTTTTTTATAAGCGTGGCCGCCACCGGAGCCACATCTTTCGCTTTGTATGCGTTGAAAAAAACCGACGTGGTTATTGATCGGAAAAGAAACCCAGAGCCTTGGGAAATGGTGGATCCTACTCAACCCCAAAAGCTTATAACCATCAACCAGCAATGGAAGCCCGTTGAGGAGCTGCAAAAAGTCCGGAGGGCAACCAGATGATTGCTCACCACTCCTCTCTTCCAAAGAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACATTTCTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGCTACATTTGTAGGGTTTGCCTGCATTCTTTGGATCCTGCATTAGCAAGTGAAGGTAGCACATAGTCTAAAATAGTTTTCTGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGCTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTGCCTGTAATAAAATAATTCGATGACTATCTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTC 4 0 5' arm Mus_musculus mirnest mir-147 1e-22 mmu-mir-147 2e-39 -36 ....(((((((((((.((((((((.((((((((((((...................)))))))))))).)))))))).)))))))))))... (-36)