mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCTGTCTTCCCCATC GTGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATGCATACAGAGTGAGAGAGACATTTCTTGCTCGAGTTATGACTCTTACCTACTATAGATTTTGTTGGCCTCAGTGAGTTAGTTCTTCATGTGCCTGTCTTCCCCATCATGATCACTA 5 0 5' arm Populus_tremula_x_Populus_tremuloides pmrd MIR164 1e-72 ptc-MIR164e 1e-72 -62.3 ((((.((.(((((.((((..(((((((((....((((((((((.(((((.(((..(((((....)))))..)))..).)))).......((.((..........)).)).....))))))))))....)))))))))..)))).))))).)).)))).. (-62.30)