mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTCTGACAGCCTCACT AGGGAAAAGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAGAGAAGTATAGAAGCGAAGAACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCCTGTT 2 2 5' arm Populus_tremula_x_Populus_tremuloides pmrd MIR167_1 4e-47 ptc-MIR167d 9e-48 -43.2 .(((((..(((((.(((((.(((((((((((.((..((((((....((......))......))))))..)).)))))))))))..).)))).)))))..)))))... (-43.20)