mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGCGGAAATGCTTCTGGT TGGAAACATTTCTGCACAAAT CACAGAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACATTTCTGCACAAATTAGAACTTCATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGGTACATTTGTAGGGTTTGCCTG CCACAGAACACTCTATGAATCTAGTGGAAACATTTCTGCACAAATTAGAACTTCATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTCTGGTACATTTGTAGGGTTTGCCTGCATTTTTTGGATCCTGCATTAGCAAGTGAAGGTAGCACATAGTTTAAAATACTTTTCTGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGCTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTGCCTGTAATAAAATAATTCGATGACT 3 0 3' arm Mus_musculus mirnest mir-147 0.0000000000004 mmu-mir-147 2e-27 -31.4 ........(((((((((((.((.(((((.((((((((((((...................)))))))))))).))))).)).)))))))))))....... (-31.4)