mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCCGCATGGACCGAAG AATGTGCTTTTGGAGTTGTGAACCTTGCTGTGAGGAATGCCGCATGGACCGAAGCTATGTGCTCCATCTTAACGTGGTGGTATTGATACTACGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGCGCAGTTTCATCATGGTGATGGACGG 5 0 3' arm Physcomitrella_patens pmrd mir-166 1e-47 ppt-MIR166e 3e-79 -47.9 ..(((.((.(((..((.(((((.(((((((.(.((((((..((.(((.(((((((...((((.(((((.......)))))....).)))...))))))).))).))..)))))).).))))).)).))))).))..))).))))). (-47.90)