mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGCTGCATGGTCTGATG ATGACCAGCATACCAGTGGTGCTGTGCTGGGAGGAATGCTGCATGGTCTGATGCTTTTGCTGCGACACAAGCCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGCTCAGTCTCATATTGACGGTTCAAG 4 0 3' arm Physcomitrella_patens pmrd mir-166 4e-35 ppt-MIR166f 1e-65 -54.4 .(((((..((.....(((..((((.((((((.((((((..((.((((((((.((((.((......)).)))).)))))))).))..)))))).)))))).))))..)))..))..)).))).. (-54.40)