mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTCCGTTTCGGTCCAATAG GTGGAGCTCCGTTTCGGTCCAATAGTGGCTGCGACGGAAGGTGGTCCCGCTGCCGAATCACACGTCCGGGTTGCTTATCGGGGCAGGGCCCCGATACGGTATCCGAACGTTTGTCCCGGGAACTGGTCGACCTTCCGCCCGGCGTCTCTTGGACTGAAGGGAGCTCCAC 1 1 3' arm Physcomitrella_patens pmrd MIR159 0.0002 ppt-MIR319a 6e-93 -98.8 ((((((((((.(((((((((((.((..((((.(.((((((((.(.((.(.(.(((...((.((((.(((((.((((((((((((...))))))))).)))))))).)))).))...))).).).)).).)))))))).)))))..)).))))))))))))))))))))) (-98.80)