mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCCCTCAAAGGCTTCCA GATGCCTTAGTGGGAGATG TCAGAGGGAGTATACTCAGGTGTTTGTTTTTCTCCCTCAAAGGCTTCCAACTACATCAGCATTCTATTCCACTTCTGGCTTAAGATGCAGTGAATTTGCGTTGTTGTTGGATGCCTTAGTGGGAGATGTACATACCCCTGTCATTGATGTGTTGC 3 0 5' arm Physcomitrella_patens pmrd MIR477 0.0000000006 ppt-MIR477h 1e-84 -50.9 .(((.(((...((((....)))).(((...((((((.(.(((((.((((((.(((...((((..((..(((....)))..))..)))).((......))..))).)))))).))))).).))))))...)))..))))))............... (-50.90)