mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGAGAGAGAGTACAGCCC GCTGTGCTCTCTCTCTTCTGG TCAGCAATTTACTCACTCATGCTGGGATCAGAAGAGAGAGAGTACAGCCCAAGAGCAACCGCTTAGTTGGAATGGGCTGTGCTCTCTCTCTTCTGGTTCCAACCTGAGTGCATGTCGGTTGT 0 0 5' arm Physcomitrella_patens pmrd 100 ppt-MIR529e 5e-65 -73 ...(((((..((.((((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((....((((......))))...))))))))))))))))))))))))))))).).))))))...))..))))) (-73.00)