mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCGTGCCAAGCTTTGTGCTTT CGCCAATGCTTGGCATGAATG TTGTTCGACCATTGCAGTTGCTTTTAGACGCCAATGCTTGGCATGAATGTCTTGAGTGTCTGGTAGCCTAAAACAGAGAGATGATGCAATTGGTATGTGGATCTTCTCTGGTTTTAGAGGAATCGTTCGCTGGCCTCCAGGTTCGAGACAATCGTGCCAAGCTTTGTGCTTTCAAGAGCCTTAATGGTTTTGGACGATGGGTTCTACTGGATCTCTAACATC 4 1 3' arm Physcomitrella_patens pmrd 100 ppt-MIR536c 2e-124 -84.5 ((((((((((((((.((..((((((..(.(((((.(((((((((((.(((((((((..(((((..(((.(((((..(((((.(((.((.........)).))).))))).))))).((....)).......)))..)))))))))))))).))))))))))).))).)).)..))))))))))))))))..)))))).((((((....))))))........ (-84.50)