mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGCTCGGCTCGGCTCCGGAC CGTGGCGGGCGCAGCGGG CTTTCATTTGTAGGCTCGGCTCGGCTCGGCTCCGGACTCCACTGCAGCAGATTCGCCTCACTCGCCTGGCTCCGCCCTAGCCGGGCTCACGGCGGGTGGCGGCGTGCGTGGCAGTCGGCCGTGGCGGGCGCAGCGGGCCTC CTCTCGGTAGCACGCTTCCTTCAGTGGCGCACGGTCCTCGCTACCGGATTCCCATCCCCCAGGTTCGCCGGAGCCGCAGGCTCTCCTTAGTCGCGGGTTTGCACACGCTGCAGGGTATGGGCTCCAGATTCCTTTCATTTGTAGGCTCGGCTCGGCTCGGCTCCGGACTCCACTGCAGCAGATTCGCCTCACTCGCCTGGCTCCGCCCTAGCCGGGCTCACGGCGGGTGGCGGCGTGCGTGGCAGTCGGCCGTGGCGGGCGCAGCGGGCCTC 4 2 5' arm Mus_musculus mirnest 100 tgu-mir-2974 0.0004 -62 ...........(((((((.((..(((((.((.(((.((..(((((.(((....(((((((((((((.(((((.((....)).)))))...))))))))).)))))))...))))).))))).)))))))..))))))))). (-62)