mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTCCTGCCTCTCACTAGCTT CTATTGGGAAGCAGGAACAG CTCTTCCTGCCTCTCACTAGCTTCATCCCTTCGAACCCGAAGGTACTAAGGTAAGGAACTATTGGGAAGCAGGAACAG 3 1 5' arm Physcomitrella_patens pmrd 100 ppt-MIR1219b 5e-39 -29.4 ((.(((((((.(((((.(((.(((...((((((....))))))(((....)))..)))))).))))).))))))).)) (-29.40)