mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGGGAGCTCCA GAGCTCCCTTCAGTCCAACCA TGGAGCTCCCTTCAGTCCAACCAAAGCTTGTGCGGCGGTGGTTCAGCTGCTGATTCATGCATTCGACTGCCCTGTCCGTGACTTTCCAGCAGCCTGAATCAATCAATCTATCTCCATGACAGGATAGTGGTGTGCATGACGCAGGAGATGTATTGTCACTGGACACGCATTCCTTGGATTGAAGGGAGCTCCA 2 0 3' arm Picea_sitchensis pmrd 100 pta-MIR319 4e-73 -87.9 .(((((((((((((((((((..((.((.(((.(((.((..((.((.((.(((..((((((((.(.((((.((((((..((......))..((..(((.....)))..))........)))))).)))).).))))))))..))).)).)).))..)).))).))).)).))..))))))))))))))))))). (-87.90)