mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACATTTCTGCACAAAC GTGTGCGGAAATGCTTTTGCT AAGAACATTCTATGAATTTACTGGAAACATTTCTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTTTGCTACATTTGTAGGGTTTGCC CGGGGCAACCAGATTATTCCTCACCATCTATATTCCAAAGAACATTCTATGAATTTACTGGAAACATTTCTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGCTTTTGCTACATTTGTAGGGTTTGCCTGCATTCTTTGGATCCTGCATTAGCAAGTGAAGGTAGCACATATTTTAAAATAGTTTTCTGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGCTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTCCCTGTAATAAAATAATTCG 4 0 5' arm Mus_musculus mirnest mir-147 4e-16 mmu-mir-147 3e-32 -27.1 ..((((...((((((((.((.(((((.((((((((((((...................)))))))))))).))))).)).)))))))).))))... (-27.1)