mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGAAGATAGAGAGCACATC TGTGGTCTCCATGATTCTGTC GATGACAGAAGATAGAGAGCACATCCGCTCACATGCCGGGACTCTGCGTTTGAGGTGTATGTGGTCTCCATGATTCTGTCATC 4 1 5' arm Pinus_taeda pmrd 100 pta-MIR156a 6e-42 -36.2 ((((((((((.((.((((.(((((.((((((.((((.((....)))))).))).))).))))).)))).))..)))))))))) (-36.20)