mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGACT TTGATTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGACTTCATCCGGATTTGGGCTCCAATGTTCGGATGCCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATCGG 4 0 3' arm Pinus_taeda pmrd mir-166 0.00000008 pta-MIR166a 2e-48 -55.6 .((((((.((((((((..((((((..((((..(((((((((((((...)))).)))))))))..))))..))))))..)))))))).)))))). (-55.60)