mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGCGGAAATGTTTCTGCT TGGAAACATTTTTGCACAAAC AAAGAACATTCTATGATTTTAGTGGAAACATTTTTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGTTTCTGCTACATTTGTAGGGTTTGCCT AACCAGATGATTGTTCACCATTCTTTTTTTCCAAAGAACATTCTATGATTTTAGTGGAAACATTTTTGCACAAACTAGATGTTGATGCCAGTGTGCGGAAATGTTTCTGCTACATTTGTAGGGTTTGCCTGCATTCTTTGGATCCTGCATTAGCAAGTGAAGGTAGCACATATTTTAAAATAGTTTTCTGTGTTTATTGGTGTAAATTTCAATTTTACAGTTGAAATTTTATGTTTGTGATGCTTGGATATTTTCCTTGAAATGTATAAACATGTAAAAATTAGATTACTCCCTGTAATAAAATAATTCGATGACTATCTGT 1 0 3' arm Mus_musculus mirnest mir-147 0.000000000000002 mmu-mir-147 6e-30 -31.8 ...((((...((((((...(((((((((((((((((((((...................)))))))))))))))))))))...)))))).)))).... (-31.8)