mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGCTGTGTGGGATCCGG GGATCCTACAAACCCTGTTT AAGTCATGAAATCAGGCTGTGTGGGATCCGGTAACGCCACAGAGTAAGATAGCAGCGTCAAAGTGACTGTAGGCATTGGTGGATAAAGTGAAGCGGTATTGATGAGGCCTCACATTGTCCACCGATGCCTACAGCCACTTTGACGTTCTCATCTGATTTTATGACGGCCTCACTTCCTCCGCCAATGCCTGAGGCGGTGTCATCTGTTTTTGCGGCATTACCGGATCCTACAAACCCTGTTTTCATGGGTT 4 0 5' arm Pinus_taeda pmrd 100 pta-MIR948 1e-141 -133 ((.((((((((.((((...(((((((((((((((.(((.((((...((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((.((..((....))..)).)))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))).))))........(((((...((((.((((.((....))..)))).))))....))))))))).))).)))))))))))))))...)))).)))))))).)) (-133.00)