mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTCCTCGGTGGTTTAT AAACCATCGTGGAGCCGATG GGAAGGTGATCTTTACATCAGGTCCTCGGTGGTTTATTGCTCATCGTTTGTTTATAATAAACCATCGTGGAGCCGATGAAAAGAGCACCTCC 3 0 5' arm Pinus_taeda pmrd 100 pta-MIR950a 3e-47 -41.5 (((.((((.(((((.((((.(.(((.(((((((((((((..((.....))....))))))))))))).))).).)))).))))).))))))) (-41.50)