mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATACAATCTACTGTCTTTC AGGTAGTAGGTTGTATAGTT GGGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCACACCCACCACTGGGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGTGA GGGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTTAGGGTCACACCCACCACTGGGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGTGATGGAAAAGTCTGCATTCATGGGGTCTCATAGGAAACCAAGAACAAACTGCAGTGTTTTAAAGTATATCTTGCCTTAAAAGCATTTGCTTATGCTATGCATGCTTTTTAATTTAACAAGTAGATGATGGGAATGGGCAAGTTTTTACTTACTTTGCATTCTGTGTCAATGTAAATGAAGATTTAATTTTGATTGATGATGATGATTTAATGTTAACCTTTCTTGAAAGAGACTGATGCTTATTCCAGAAGAAAAACTTGCTCTATCAGAGTGAGGTAGTAGATTGTATAGTTGTGGGGTAGTGATTTTACCCTGTTTAGGAGATAACTATACAATCTATTGCCTTCCCTGAGGAGTAGACTTGCTGCATTGTTTTTATCTAGAGGATATTATAAAACATAGGTGAATTCTGACCTTTTGTTTTATTTTACAGTTCATTTCCTCAGTGCAATAAACATTGTTATAACATTTTTAGTGTTCATGTTTAAAGAAATTTGGACAAATATCTGAATGAGAAAAGTAAGTATCTANGACCAGGCCTTTTGGGATTATTAATAGATGTATAGTTTTATATTTCTGTTACACATGCCCAGAGAAAGATGTCACAGGTAAATGGGCATACCAACTGGAAGGGTACTGCTGGACTAAATTGAAATCTGGTTATTTTATTATCATACTTAAAATGCTCTGAGTATTATATTACTTCCCTGGTATATTGATTTGGACACACCCAGGAAAGAAGGGCTCTGGCTTCTGCCTTACTTCTCCTAAGGGCTCAATTTTTCCCACCAGACAAGGGAAGCCCCCAAAACTCGGGTTGGACAAACCCCATAATTGGTACCTTGAAAGAAAAAATGAAAGGGGGTTTTTTAAAGGGGACTTGATTGTTAGCCGTGTTGATGGGCTTCAGGTTCAGCCTTTCTAAGGG 0 1 3' arm Mus_musculus mirnest let-7 9e-32 mmu-let-7a-1 4e-40 -29.5 (((((((((((((((((((((((((.((((...)))).((....)).)).))))))))))))))))).))))))........ (-29.5)