mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGGATGCCA GCATCAGAGGAGTCATGCAGG GGGATCAATCTGCCTGGCTCCCTGGATGCCAACTAAGAAATTTGTCGAGTGGTCTTGACTCTTCATAGTTGGCATCAGAGGAGTCATGCAGGTCCAAC 1 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-160 0.0000000004 ptc-MIR160g 8e-51 -50.4 .((((....((((.((((((((((.((((((((((.(((....((((((....))))))..))).))))))))))))).))))))).))))))))... (-50.40)