mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGCATGCCA GCGTGCAACGAGTCATGCATG GATCCCTGTGTGCCTGGCTCCCTGCATGCCATTTGCATAGCTCATCAGAACGTCGGTGGCCTTGGTGGATGGCGTGCAACGAGTCATGCATGCTGTGA 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-160 2e-42 ptc-MIR160h 8e-51 -45.5 ..((.(.((((((.((((((..(((((((((((..(...((.((((........))))))....)..)))))))))))..)))))).)))))).).)) (-45.50)