mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGTGCTCCCCTCCTCCAAC TGGCTCACGCTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAATCCTTCTCGGCTTCCAGATGCTGATGAAGCACTCTTTGCACGTGCTCCCCTCCTCCAACATGAGT 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR164 9e-42 ptc-MIR164d 2e-51 -47.4 ..(((((.(.(((((.((..(((((((((((((...(((((((((........))))).)))).....)))))))))))))..)).))))).).))))) (-47.40)