mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACATGCT CATGTGCTCTATCTCTCCAGC TGAGCCATGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATCAGCTTGAAAGTCTGATAGTTTTGCATGTGCTCTATCTCTCCAGCTTGGAC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR164 8e-45 ptc-MIR164f 4e-46 -48.7 ....(((.((((((((.(.(((((((((((.(((.(((((((((....)).))))))).)))))))))))))).).)))))))).))).. (-48.70)